Numerosas bacterias pueden ocasionar infecciones agudas y crónicas del tracto genital bajo. Entre ellas:
Las bacterias anaeróbicas se desarrollan especialmente en cavidades cerradas como las glándulas de Bartholino que se encuentran a la entrada de la vagina. Pueden producir un abceso o quiste infectado que es muy doloroso.
Habitualmente, las infecciones bacterianas se asientan en el cuello del útero y dan lugar a una cervicitis aguda o crónica.
Especial mención de las infecciones bacterianas del tracto genital bajo -por su trascendencia social- tienen las infecciones por Neisseria ghonorreae, un diplococo Gram (-) intracelular que comprometeel epitelio columnar y de transición que tapiza el tracto genital (endocervic, trompasde Falopio) lo que puede causar infertilidad por obstrucción tubaria.